서울 대원사는 대한불교보문종 비구니 일조스님(日照)이 1947년에 주지로 역임한 적이 있다. 2024년 현재 대한불교보문종 홈페이지에 대한불교보문종 사찰로 등재되지 않은 것으로 보아 대한불교보문종 사찰은 아닌 것으로 보인다.